Non-Heme Iron Enzymes Catalyze Heterobicyclic and Spirocyclic Isoquinolone Core Formation in Piperazine Alkaloid Biosynthesis

Mai‐Truc Pham, Feng‐Ling Yang, I‐Chen Liu, Po‐Huang Liang, Hsiao‐Ching Lin
Angew. Chem. Int. Ed. 2024, 63, e202401324

中央研究院 生物化學研究所  林曉青副研究員

Piperazines廣泛存在於活性化合物和藥物的化學結構,如抗腫瘤藥物Ecteinascidin-743和具有影響精神活性的 meta-chlorophenylpiperazine。源自苯丙氨酸(L-phenylalanine)的piperazine生物鹼,在其化學骨架的piperazine環上,常有多個芳香性官能基取代,由於piperazine六元環具有不同的構形異構和結構靈活性(flexibility),因此在天然物中常可見到piperazine生物鹼引人入勝的多環融合環骨架。儘管它們具有重要的生物活性和結構多樣性,但其在自然界的生物合成途徑、遺傳和生化基礎,尤其是在那些具有融合雜環骨架的piperazine生物鹼,目前為止仍然不清楚。本研究以生物資訊方法在真菌 Penicillium arizonense的基因體序列中,找到生物合成基因簇 par,並發現在實驗室培養條件下, P. arizonense能夠生產多種piperazine生物鹼,純化並解析為具有特殊heterobicyclic isoquinolone新骨架的天然物arizonamides A和B。我們利用基因剔除實驗、異源表達和 in vitro酶反應實驗,表徵arizonamides的生物合成途徑,並發現兩種關鍵的非血紅素鐵酶,ParF和ParG,負責構建arizonamide和arizolidine的核心骨架。ParF具有雙重功能,既促進helvamide的2,3-烯烴形成,作為ParG的受質,又進行piperazine的氧化裂解。ParG在多種氧化反應中表現出催化多樣性,涉及環化和環重構。值得注意的是,我們鑑定出控制ParG形成受限arizonamide骨架的關鍵氨基酸。總體而言,這些酶的表徵將不僅有助於產生具有piperazine衍生的多環融合環骨架之化學複雜性,並將為這些酶的工程改造開闢新途徑。

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