寡核苷酸藥物(oligonucleotide-based therapeutics)近年來快速崛起,過去十年就有超過二十種獲得核准。為了讓這類藥物在體內更穩定,科學家會改造它們的骨架,最普遍的改造方法是把磷酸二酯鍵上的一個氧原子換成硫原子,形成硫代磷酸酯(phosphorothioate,PS)鍵。這個看似輕微的改動,能大幅提升寡核苷酸抵抗核酸酶分解的能力,也讓人體細胞更容易吸收,因此幾乎所有經美國食品藥物管理局核准的反義寡核苷酸(antisense oligonucleotide,ASO)藥物都帶有PS鍵。然而,氧換成硫之後,磷原子上接的四個基團彼此不同,磷本身也成了掌性中心。以藥物nusinersen為例,它含有17個PS鍵,就有131,072種立體異構物。更麻煩的是,不同構型的療效差很多:藥物mipomersen中,Sp構型的PS鍵比Rp構型穩定,帶有3'-SpSpRp排列的樣品,在體內的持久性與藥效都勝過構型隨機的類似物。但主流的「P(III)亞磷醯胺合成法」無法控制磷的構型,只能得到異構物的混合物,既難以純化,也阻礙了機制與療效研究;改用共價接上的掌性輔助基雖能控制構型,但需要多步合成輔助基、用掉與產物等量的試劑,還要靠層析分開異構物,以上種種原因導致難以放大生產。
近日,中國上海交通大學的研究團隊,成功開發出以掌性雙脒(bis(amidine))有機催化劑控制磷構型的P(V)平台。他們所用的P(V)試劑,是以五氟苯酚(pentafluorophenol)為離去基,是一種能長期存放的白色固體,且可由便宜原料大量製備。反應分兩步,第一步「上載」由催化劑決定構型,催化劑上喹啉的氮先攻擊磷中心,N-H則與磷上的硫形成氫鍵固定住錯合物,另一端的氮再當鹼奪走核苷5'-羥基的質子,使羥基只能從特定方向進攻磷,產率80%、非對映異構物比例(d.r.)96:4;第二步「偶聯」接上第二個核苷,構型完全保留(>99:1),也能建立P-S、P-C與P-N鍵。該團隊還在自動化合成上做出立體構型單純的全PS修飾寡核苷酸;改用金雞納鹼衍生的催化劑後,還能做出3'端上載的單體,讓合成依主流的3'→5'方向進行,也做出立體構型單純的環狀二核苷酸(CDN)。