在引發腸道疾病前，腸道病菌都需要先在腸道內繁殖。完成繁殖，積累大量細菌後，就會引發疾病，並形成難以清除的病菌根源。隨著大腸桿菌和沙門氏菌對抗生素抵抗性的增加，科學家急需開發不使用抗生素的除菌方法，使其既能治療疾病，又能消除腸道中的細菌。然而，現有的針劑疫苗，主要是透過刺激血液中的抗體和免疫細胞來清除組織內的感染，這無法有效保護腸道。要有效保護腸道，還得依靠對人體有益的微生物群，例如將健康者腸道裡的益菌轉移到病人腸道，可以治療發炎性腸道感染。當前研究顯示，使用失去活性的細菌作為口服疫苗，可以誘導腸道產生抗體（IgA），而這些抗體能識別、標記沙門氏菌，進而將該菌聚集在一起，並促使其排出人體外。

近日，瑞士的巴塞爾大學和蘇黎世聯邦理工學院的研究團隊，基於上述發現，提出了「疫苗增強競爭」（vaccine-enhanced competition）的創新概念，即結合口服疫苗與活益生菌能有效替換腸道中的有害細菌。研究團隊首先透過數學模型證實，當口服疫苗產生的抗體與益生菌結合時，能在10天內清除致病菌。研究者隨後在小鼠身上進行了兩類實驗：一是預防性實驗，成功阻止了非傷寒性沙門氏菌的感染；二是治療性實驗，成功清除了已經存在於腸道中的大腸桿菌。實驗數據顯示，單獨使用疫苗或單獨使用益生菌的效果都很有限，必須同時使用兩者才能有效清除致病菌。研究人員進一步發現，益生菌需要能夠消化與致病菌相同種類的營養素，才能發揮最佳效果。